很抱歉，由于当前的交通状况、疫情管控政策以及季节性旅游信息等因素实时变动，我无法为您提供精确到日的具体5日游方案。但我可以为您提供一个大致的参考行程：
**Day 1：**
- **出发地肇庆**：早上从肇庆市出发，如果时间允许，您可以先在肇庆市区游览，比如参观七星岩风景区，感受岭南园林的独特魅力，或者游览鼎湖山国家自然保护区，体验清新的大自然环境。
- **前往商丘**：下午或傍晚时分，选择高铁或飞机前往商丘市，晚上抵达后休息。
**Day 2：**
- **商丘古城**：全天游览商丘古城，包括应天书院、归德府城墙、侯方域故居等历史文化景点，了解商丘深厚的历史文化底蕴。
**Day 3：**
- **燧皇陵与阏伯台**：上午参观燧皇陵，这是华夏文明火文化的发源地，然后去阏伯台，了解天文历法文化。
- **黄河故道生态园**：下午游览黄河故道国家森林公园，欣赏壮丽的自然风光。
**Day 4：**
- **芒砀山汉文化旅游区**：全天游览芒砀山，这里有许多汉代石刻艺术和刘邦斩蛇碑等历史遗迹，深入体验汉文化。
**Day 5：**
- **返程准备与购物**：根据回程交通工具的时间安排，预留半天或一天在商丘市区自由活动，购买特色纪念品，品尝当地美食。然后返回肇庆。
以上仅为参考行程，具体出行前，请务必核实当地的疫情防控政策，合理安排行程，并提前预订交通和住宿。同时，考虑到两地之间的实际距离及交通情况，可能需要对行程进行适当调整以确保舒适度。
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